CPU和GPU混合体系结构上生物网络比对并行算法研究

61462005
2014
F0204.计算机系统结构与硬件技术
钟诚
地区科学基金项目
教授
广西大学
45万元
生物网络;比对;并行算法;混合体系结构
2015-01-01到2018-12-31
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序号 标题 类型 作者
1 Aligning Metabolic Pathways Exploiting Binary Relation of Reactions 期刊论文 Yiran Huang（黄毅然）;Cheng Zhong（钟诚）;Hai Xiang Lin（林海翔）;，Jing Huang（黄婧）
2 融合信息量差异和聚类精炼的多Motif发现 期刊论文 王迎国;钟诚
3 HashESU:一种生物网络模体识别高效方法 期刊论文 赵静;钟诚
4 基于DFT的RNA二级结构距离计算构建系统发育树的方法 专利 昌攀;张文影;黄毅然;钟诚
5 Reconstructing Phylogeny by Aligning Multiple Metabolic Pathways Using Functional Module Mapping 期刊论文 Yiran Huang（黄毅然）;Cheng Zhong（钟诚）;Hai Xiang Lin（林海翔）;Jianyi Wang（王坚毅）;YuzhongPeng 彭昱忠
6 Parallel Identifying(l,d)-Motifs in Biosequences Using CPU and GPU Computing 期刊论文 Cheng Zhong（钟诚）;Jing Zhang（张静）;Bei Hua （华蓓）;Feng Yang（杨锋）;Zhengping Liu（刘正平）
7 一种改进的蛋白质相互作用网络全局比对算法 期刊论文 周钰乔;钟诚
8 Parallel Aligning Multiple Metabolic Pathways on Hybrid CPU and GPU Architectures 期刊论文 Yiran Huang（黄毅然）;Cheng Zhong（钟诚）;Jinxiong Zhang（张锦雄）;Ye Li（李晔）;Jun Liu（刘峻）
9 全局基因调控网络构建CPU/GPU并行算法 期刊论文 陈绪伟;钟诚
10 通过DFT变换提取DNA序列特征聚类物种 期刊论文 昌攀;钟诚
11 用拓扑和语义信息计算熵值的PPI网络聚类 期刊论文 徐雷;钟诚;李智
12 基于启发信息并行求解无环K最短路径 期刊论文 刘正平;钟诚;高楠;张雄宝
13 CPU和GPU协同并行加速多生物序列比对 期刊论文 杨春燕;钟诚
14 基因表达数据的分层近邻传播聚类算法 期刊论文 吴娱;钟诚;尹梦晓
15 A Method for Finding Metabolic Pathways Using Atomic Group Tracking, Plos One 期刊论文 Yiran Huang（黄毅然）;Cheng Zhong（钟诚）;Hai Xiang Lin（林海翔）;Jianyi Wang（王坚毅）
16 基于多条代谢路径比对重建物种系统发生树的方法 专利 黄毅然;钟诚;林海翔
17 基于非支配排序遗传算法求解启动子识别问题 期刊论文 蒙冰;钟诚;何勇强;刘伟;王志强
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