基于Apache Spark的可扩展宏基因组序列组装方法研究

61802246
2018
F0213.生物信息计算与数字健康
邓丽
青年科学基金项目
副教授
上海大学
26万元
Apache;Spark;宏基因组学;参数优化;序列组装
2019-01-01到2021-12-31
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序号 标题 类型 作者
1 一种宏基因组序列组装方法 专利 邓丽;张晨;刘骁;武金达;卢亚康;李科学;汪丽丽
2 基于TPE的SpaRC算法超参数优化方法 期刊论文 邓丽;武金达;李科学;卢亚康
3 Global Clustering Method of Metagenome Sequences Based on Tetranucleotide Frequency 会议论文 Liu Xiao;Li Deng;Song Yang;Zhang Chen
4 Improving Metagenome Sequence Clustering Application Performance Using Louvain Algorithm 会议论文 Yakang Lu;Li Deng;Lili Wang;Kexue Li;Jinda Wu
5 A local dynamic extreme learning machine based iterative learning control of nonlinear batch process 期刊论文 Chengyu Zhou;Li Jia
6 Improve Spark-based Application Performance Using Minimizer 会议论文 Jinda Wu;Li Deng;Lili Wang;Kexue Li;Yakang Lu;Yang Song
7 A Trust-Driven Contract Incentive Scheme for Mobile Crowd-Sensing Networks 期刊论文 Minghui Dai;Zhou Su;Qichao Xu;Yuntao Wang;Ning Lu
8 Improve spark-based application performance using bayesian hyperparameter optimization 会议论文 Kexue Li;Li Deng;Yakang Lu;Jinda Wu
9 Microbial community analysis based on bipartite graph clustering of metabolic network 会议论文 Zhang Chen;Li Deng
10 Deconvolute individual genomes from metagenome sequences through short read clustering 期刊论文 Kexue Li;Yakang Lu;Li Deng;Lili Wang;Lizhen Shi;Zhong Wang
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